Müllheim → L’Isle-sur-le-Doubs
Die zweite Etappe begann mit dem Einstieg in den Radfernweg EuroVelo 6. Nach der Überquerung des Rheins führte die Route zunächst in Richtung Mulhouse im Elsass. Die Strecke verläuft durch eine flache Ebene mit landwirtschaftlichen Flächen und kleineren Ortschaften.
Hinter Mulhouse folgt die Route zunehmend den Kanälen und Flussläufen der Region. Große Teile der Strecke verlaufen auf ruhigen Wegen direkt am Wasser, häufig auf ehemaligen Treidelpfaden entlang des Rhein-Rhône-Kanals. Diese Abschnitte sind geprägt von langen geraden Strecken, Schleusenanlagen und kleinen Brücken.
Charakteristisch für diese Etappe waren die offenen Kanalabschnitte, die wenig Schutz vor Wind bieten. Über längere Teile der Strecke trat deutlicher Gegenwind auf, der das Vorankommen verlangsamte und die Etappe körperlich anspruchsvoller machte.
Der Tagesabschnitt endete in L’Isle-sur-le-Doubs, einer kleinen Stadt am gleichnamigen Fluss und einem typischen Zwischenpunkt auf der Route der EuroVelo 6.
